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正对大门的院落尽头，原本该是本殿的位置。但在这里，只有樱神树。

义行猜测，这是因为樱神初雪的本体就是这棵巨树，初雪神社又不供奉其它神明，所以没必要设置本殿来容纳御神体。

樱神树的周围，和拜殿、巫女的家一样，都被名为“玉垣”的红木栅栏包围着。

那是为了将神明的居所和俗世隔离开来，确保神域的纯净。